胎停两周后才发现是否影响大，需要根据具体情况判断。如果胚胎已经停止发育，并且没有出现异常症状，则可能不会对身体造成太大的影响。但如果还存在残留的胚胎组织，则可能会导致宫腔感染、大出血等。

一、可能不会影响大

1.身体恢复：在怀孕早期的时候胎儿还没有完全发育成型，在进行检查的时候只能够发现孕囊以及卵黄囊，而其他的相关指标都没有办法确定。所以在进行检测的时候，只能够通过抽血化验人绒毛膜促性腺激素来明确诊断。而在胎停之后体内的HCG水平就会逐渐下降，等到两周左右的时间就有可能会降至正常范围之内。在此期间并不会产生明显的不适感，所以不用过于担心。

2.避免清宫：若是胎停两周后才发现，此时胚胎组织相对比较小，而且也没有发生机化的现象，一般可以自行排出。若长时间不能够排除时，则可以在医生指导下使用药物促进子宫收缩，比如米非司酮片、米索前列醇片等，从而达到排出来的目的。

二、会影响大

1.宫腔感染：由于胎停两周后才被发现，因此在胚胎排出以后，宫颈口还是处于开放的状态，如果没有做好个人卫生护理工作，过早的发生性生活，则容易引起细菌上行感染，诱发阴道炎、盆腔炎等疾病。一旦炎症扩散还会引起腹痛、发热等症状，严重时甚至会导致败血症的发生。此时建议患者遵医嘱使用头孢克肟颗粒、阿莫西林胶囊等抗生素类药物治疗。

2.大出血：若是胎停两周后才发现，但是仍然有部分的蜕膜组织残留在宫腔内，则有可能会造成持续性的剥落，进而引发阴道流血的情况发生。如果不及时处理还有可能会引起贫血的现象发生。一经确诊，应及时配合医生通过清宫术的方式进行处理，以免延误病情。

除此之外，还可能出现三代试管筛选机构排名前十危害生殖系统等情况，建议孕妇定期到医院复查，了解自身情况。平时还要注意饮食清淡，适当进食富含蛋白质的食物，如鸡蛋、牛奶等，有助于增强体质。